Début juillet 1918, Makhno retourne en Ukraine organiser l’insurrection sous le drapeau noir. Les partisans portent de rudes coups à l’envahisseur austro-allemand et aux alliés de la Rada centrale Ukrainienne. Ils attaquent par surprise, disparaissent grâce à la complicité des paysans qui cachent leurs chevaux.
La réputation de Makhno grandit, de nombreux groupes le rejoignent. Makhno et les officiers de la « Makhnovchina » sont élus et révocables par leurs hommes. L’esprit libertaire règne...
En novembre 1918, les Austro-Allemands évacuent l’Ukraine. Makhno tient en respect les armées blanches tsaristes.
Des congrès régionaux de paysans et d’insurgés coordonnent l’activité économique. Les combattant sont sous le contrôle de la population. Les paysans ne se privent pas de faire des remarques, y compris sur Makhno. Celui-ci soutien les aspirations des paysans au lieu de leur imposer une doctrine.